DISCIPLINAS OFERTADAS PELO PPGB

 

Analise Genômica Aplicada Ao Melhoramento de Plantas 

Este curso será oferecido na forma de aulas teóricas e práticas. Serão abordados nas aulas teóricas os princípios básicos de genética genômica, base genética, desenvolvimento e aplicação dos marcadores moleculares no melhoramento genético vegetal, análise de diversidade genética, construção de mapas genéticos utilizando marcadores moleculares, mapeamento de QTLs, definição e aplicação da seleção assistida por marcadores, estratégia de genotipagem por “bulk segregant analysis”, retrocruzamento assistido por marcadores. Para as aulas práticas serão feitas extração de DNA, quantificação, amplificação de DNA vias técnicas de PCR (RAPD, SSR, EST), eletroforese dos fragmentos em géis de agarose e poliacrilamida, princípios de sequenciamento e análise de fragmento automatizada em ABI 3100, genotipagem e interpretação dos dados moleculares.

 

Genômica Vegetal (à partir de 2012)

Esta disciplina tem como ênfase as aulas práticas de laboratório em genômica vegetal. Adicionalmente serão ministradas aulas teóricas introdutórias com os princípios básicos de genética e genômica, marcadores moleculares, seqüenciamento de genomas, bioinformática, análise de diversidade genética, seleção assistida por marcadores, mapeamento de QTLs, mapeamento associativo, genotipagem em larga escala por chip de DNA, isolamento de mRNA, obtenção de cDNA e análise de PCR em tempo real. Os dados obtidos pelos alunos em laboratório (wet lab) serão submetidos à análise computacional ao longo da disciplina e posteriormente discutido em sala de aula, oportunizando o treinamento na resolução de problemas práticos relacionados ao assunto da disciplina.

 

Anatomia Vegetal

Organização do corpo da planta. Órgãos vegetativos e reprodutivos. Meristemas. Tecidos simples e complexos. Tecidos secretores. Estratégias adaptativas

 

Biologia Celular

Serão abordados aspectos teóricos e práticos de tópicos relevantes em biologia molecular. O Curso terá como objetivo básico o desenvolvimento de técnicas atuais em biologia molecular, utilizando-se um modelo experimental definido.

 

Biologia do Desenvolvimento

Fundamentos dos processos embriológicos dos animais, especialmente vertebrados, com enfoque em fatores moleculares relacionados ao desencadeamento de aspectos gerais do desenvolvimento e envolvimento de variáveis ambientais no desenvolvimento normal e na má formação dos processos celulares, teciduais e orgânicos.

 

Biologia Molecular I

Serão abordados aspectos teóricos da estrutura e biossíntese de nucleotídeos, do metabolismo de DNA, do metabolismo de RNA, do processamento de RNA, do metabolismo de proteínas e da regulação da expressão de genes.

 

Biologia Molecular II

Regulação da expressão gênica. Direcionamento de proteínas. Bases moleculares das mutações e sistemas de reparo. Elementos genéticos móveis. Estrutura molecular.

 

Cultura de Células Animais Aplicadas ao Tratamento de Câncer

Os cultivos de células têm sido usados cada vez com maior freqüência em laboratórios, em subtituição ao emprego de animais de experimentação, por diversos motivos. Essa tendência se nota tanto entre os pesquisadores ligados às universidades e aos institutos de pesquisa, como nos que trabalham em laboratórios das empresas de produtos farmacêuticos, produtos alimentares, cosméticos, entre outros. O curso oferece informações técnicas e práticas sobre cultura de células, incluindo a descrição e discussão de protocolos de obtenção de vários tipos celulares. Descrever os princípios básicos da cultura celular (normas, técnicas, preparo e padronizações), as características da cultura de células permanentes e primárias, a contaminação por micoplasma e a aplicação da cultura como estratégia de estudo (análise da proliferação, fagocitose, metabolismo diagnóstico virológico, transfecção, fusão nuclear, morte celular, uso de marcadores fluorescentes e citometria de fluxo).

 

Engenharia Genética

Aspectos teóricos e práticos da Tecnologia do DNA Recombinante. Análise dos principais tipos de vetores, suas principais características e diferenças. Estratégias de clonagem de genes, construção de bibliotecas genômicas e de cDNA. Projetos Genomas; Genômica; metodologia de PCR e RAPD.  Discussão de artigos científicos publicados recentemente.

 

Enzimologia

Estrutura e função de sítios de interação de proteínas. Mecanismos de catálise. Significado fisiológico das interações enzimáticas. Aplicações industriais de enzimas.

 

Ferramentas Moleculares Aplicadas ao Diagnóstico

O curso abordará os conceitos necessários para a compreensão das principais ferramenteas moleculares mais utilizadas para o diagnóstico. O conhecimento dos fundamentos teóricos das diversas técnicas moleculares existentes é essencial para a escolha da ferramenta mais adequada para cada situação. Por meio de aulas teórico-práticas, serão abordadas estratégias de utilização e padronização de diversas técnicas moleculares em diferentes situações, bem como a introdução de estratégias de análise de dados genéticos obtidos por essas técnicas.

 

Filogenia Molecular

Sistemas de classificação biológica. Evolução molecular. Modelos de evolução de DNA e proteínas. Alinhamento de seqüências. Métodos de reconstrução filogenética: métodos baseados em parcimônia, métodos baseados em matrizes de distância, método da máxima verossimilhança e inferência Bayesiana. Construção e análise de árvores filogenéticas. Polarização. Aplicação dos métodos de análise filogenética na análise de seqüências de DNA e proteínas.

 

Fisiologia e Bioquímica de Princípios Ativos de Plantas

A disciplina descreverá as principais rotas do metabolismo secundário relacionadas à sintese de compostos fenólicos, com ênfase em metabolismo de taninos hidrolisáveis e condensados, flavonóides, fenilpropenos, terpenos, alcalóides, ligninas e lignanas, cumarinas, cinamatos, fitoalexinas, antocianinas, antraquinonas, flavolignanas e isoflavonóides. Em seguida serão abordados as principais metodologias farmacológicas para o estudo de plantas medicinais.

 

Genética Avançada

Genética clássica. Padrões de herança. Organização do genoma. Mutação. Locos complexos e complementação. Alterações gênicas: gene em ação. Manipulação gênica em plantas. Polimorfismos moleculares em população. Marcadores e mapeamento genéticos. Herança extra-nuclear.

 

Histoquimica e Imunohistoquímica

Conhecimento das reações de colorações gerais com enfoque especial na química celular, indicando métodos de reconhecimento de lípides, carboidratos, ácidos nucléicos e proteínas que sirvam de base para o entendimento dos processos de marcaçaõ específicas por meio das reações antígeno-anticorpo a nível de microscopia de luz e eletrônica, abordagens dos aspectos imunológicos gerais que permitam a compreensão da síntese de imunoglobulinas e da aplicação destas metodologias de forma  multidisciplinar e ampliada.

 

Imobilização de Biomoléculas

Na disciplina serão abordados os aspectos teóricos e práticos  das diferentes técnicas utilizadas nos processos de imobilização de biomoléculas, com destaque para imobilização de enzimas, os efeitos que cada técnica pode causar sobre a biomolécula imobilizada e as metodologias desenvolvidas para sua avaliação, bem como as aplicações das técnicas e suas implicações biotecnológicas.

 

Interações Microorganismos-plantas

Fixação de nitrogênio.Microorganismos benéficos. Microbiologia e produção de plantas cultivadas.

 

Introdução à Genômica

Serão abordados temas da área de genômica estrutural e funcional. Serão realizadas análises computacionais e anotação das seqüências de DNA obtidas, utilizando-se ferramentas e programas de bioinformática, tais como Blast, Clustal, Generunner, Interpro, entre outras. Serão abordadas técnicas utilizadas na validação da expressão de genes. Aspectos mais relevantes da área serão abordados com bibliografias recentes de revistas indexadas.

 

Metabolismo Celular

Características metabólicas de tecidos e órgãos. Mecanismos de regulação da atividade enzimática. Regulação hormonal do metabolismo intermediário: transduçao de sinal.  Integração do metabolismo de carboidratos, lipídeos e proteínas. Distúrbios do metabolismo energético.

 

Métodos Biométricos I

Introdução; planejamento de experimento; noções de técnicas de amostragem; análise exploratória de dados; Análise inferencial;  análise de conjuntos de dados; análise estatística para dados de freqüência; associação entre variáveis.Estudos de casos em: Análise Exploratória de dados; Delineamentos e Análise de Experimentos; Análise de Regressão; Análise de dados multivariados.

 

Sinalização Celular

Princípios gerais da sinalização celular. Moléculas sinalizadoras e componentes gerais de um processo de sinalização; Classificação de receptores de membrana e citoplasmáticos. Modelos clássicos de sinalização celular. Mecanismos de regulação dos processos de sinalização celular

 

Temas em Biologia

Discussão de aspectos gerais de filosofia da ciência e metodologia da pesquisa em Biologia; dedução e indução; divulgação científica; ciência e pseudociência; seminários.

 

Técnicas em Biologia Molecular

Serão abordados os métodos de extração de DNA, RNA e proteínas; Análise e quantificação dessas moléculas; discussão de dados comparativos. Será um curso teórico-prático.

 

Tópicos Especiais em Bioquímica

A disciplina tem como objetivo a criação de  um foro de debates sobre os avanços recentes da Bioquímica, de maneira a permitir que os alunos adquiram conhecimento atualizado e desenvolvam comportamento crítico, complementando a formação individual naquilo que não é possível adquirir-se através do trabalho de tese e de outras disciplinas de natureza específica.

 

Tópicos Especiais em Farmacologia

A disciplina propõe a atualização de temas relacionados à Farmacologia em modelos experimentais para o estudo de novas fontes de fármacos naturais ou sintéticas, análise da interação fármaco-receptor, bem como a compreensão das características bioquímicas e moleculares relacionadas aos efeitos biológicos promovidos por estes fármacos. 

 

Tópicos Especiais em Fisiologia

Conceitos básicos de Fisiologia Cardiovascular: eletrofisiologia cardíaca e autonômica, bomba cardíaca e hemodinâmica. Conceitos atuais sobre a participação de neurotransmissores no controle da pressão arterial. Peptídeos bioativos no controle das funções cardiovasculares - ênfase no Sistema Renina-Angiotensina. Técnicas experimentais utilizadas para avaliação dos efeitos cardiovasculares de moléculas bioativas.

 

Redação de artigos científicos

A disciplina tem como objetivo aprimorar o conhecimento dos pós-graduandos em técnicas de redação científica. O conteúdo inclui o estudo das diferentes formas de registro bibliográfico através da análise das normas de diferentes tipos de periódicos. São desenvolvidas técnicas de redação de artigos científicos; conhecimento e determinação do fator de impacto e classificação pelo Sistema Qualis; elaboração de artigo de própria autoria e que satisfaça às exigências de um periódico de boa qualidade convenientemente escolhido;  análise e emissão de parecer de artigo científico. 

 

Genética Toxicológica 

Estudo dos métodos de análise empregados em Genética toxicológica, seus fundamentos e aplicações. Monitorização terapêutica, monitorização ambiental e biológica e análises toxicológicas. Mutagênese, carcinogênese e teratogênese: origens, consequências e mecanismos de prevenção. Conceituar substâncias mutagênicas e anti-mutagênicas. 

 

Microscopia eletrônica aplicada à biologia celular e molecular

Introdução aos princípios básicos da microscopia eletrônica de transmissão (MET). Aplicação da microscopia eletrônica à biologia celular e molecular. Princípios físicos da MET: sistemas de iluminação, lentes e formação de imagem. Métodos de fixação e preparação de sistemas biológicos para MET. Ultramicrotomia: obtenção de cortes semifinos e ultrafinos. Contrastação negativa e marcação específica de amostras para MET. Análise e interpretação das secções ultrafinas para identificação dos componentes celulares à MET. Obtenção e processamento de imagens em MET. Métodos qualitativos e quantitativos de análise à MET. Análise tridimensional das imagens obtidas no MET.